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LeDock 2019免費版分子對接工具

101人評分

  • 軟件大?。?/span>15.1MB
  • 更新時間:2018-09-14
  • 授權:免費軟件
  • 軟件類型:國產軟件
  • 軟件類別:國產軟件
  • 語言:簡體中文
  • 平臺:Win7/Win8/Win10/WinALL
  • 平臺檢測:
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LeDock是久友下載站小編極力推薦的一款分子對接工具。分子對接軟件中的佼佼者 LeDock 。為了快速準確地將小分子對接成蛋白質而設計的。在Astex多樣性集上,它實現了大于90%的位姿預測精度,并且對于藥物樣分子,每次運行大約需要3秒鐘。它導致從高通量虛擬篩選運動中發現新的激酶抑制劑和溴代氨酶拮抗劑。它直接使用SybYLMOL2格式作為小分子的輸入。Windows操作系統上的圖形版本極大地簡化了藥物化學家的常見多重復雜的對接過程。

使用說明:

  1. 抽取受體。

  直接運行 LeDock.exe

  結果可以發現,Lepro可以自動去除雜原子,并加氫,殘基的名字也改為charmm的命名方式。Arg226在晶體結構中構象不確定,Lepro自動保存第一個;

  2. 對接的盒子

  Lepro還產生一個dock.in的對接配置文件:

  輸入文件包含以下信息:

  //

  Receptor

  pro.pdb

  RMSD

  1.0

  Binding pocket

  xmin xmax

  ymin ymax

  zmin zmax

  Number of binding poses

  20

  Ligands list

  ligands.list

  //

  “Receptor”、“Binding pocket”、“Number of binding poses”和“Ligands list”是關鍵詞,不可更改。

LeDock

功能特點:

  位姿預測的高精度

  用戶友好的虛擬篩選和點擊細化

  非???/p>


標簽: 分子對接

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應用截圖

  • LeDock截圖(1)

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